Diversidade molecular em estirpes de Pseudomonas savastanoi isoladas de nódulos de Olea europaea L. portuguesa

Abstract

Pseudomonas savastanoi provoca a doença dos nódulos de oliveira. Neste estudo aplicou‐se uma abordagem polifásica na caracterização de isolados (produtores de IAA) obtidos a partir de nódulos de três variedades de oliveira. Aplicaram‐se testes fenotípicos clássicos e moleculares, nomeadamente para deteção do gene iaaL, PCR‐RFLPs do rDNA 16S e 'fingerprinting' genómico por BOX‐, ERIC‐ e REP‐PCR. Obteve‐se uma grande heterogeneidade fenética entre isolados identificados como P. savastanoi. Recorreu‐se à sequenciação do rDNA 168 e verificou‐se que apenas um isolado apresentava homologia com P. savastanoi, sendo os restantes homólogos de Pantoea agglomerans, Pantoea oleae e Erwinia toletana, comprovando a falta de fiabilidade dos outros métodos de identificação utilizados. Ficou também claramente demonstrado que o gene iaaL associado à patogenicidade não é exclusivo de P. savastanoi, levantando a hipótese de esta espécie não ser a única responsável pelo aparecimento de nódulos em oliveira. /ABSTRACT ‐ Pseudomonas savastanoi cause a disease known a olive knot. ln this study a polyphasic approach was applied for the characterization of strains (IAA producers) isolated from three varieties of olive trees. Both classic phenotypic and molecular tests were applied, in particular for detection of the iaaL gene, PCR‐RFLPs of 16S rDNA and genomic fingerprinting using BOX‐, ERIC‐ and REP‐PCR. High fenetic heterogeneity was obtained among isolated strains identified as P. savastanoi. Sequencing of 168 rDNA revealed that only one isolated strain showed homology with P. savastanoi, while the remaining strains were homologous to Pantoea agglomerans, Pantoea oleae and Erwinia toletana, proving the lack of fidelity of the other identification methods used. lt was also clearly demonstrated that iaaL gene associated with the disease is not exclusive of P. savastanoi, which suggests that this species is not the only one responsible for the “olive knot".