Diversidade microbiológica no solo temperado - uma análise estrutural e funcional com uso de técnicas moleculares de "fingerprinting"

Abstract

Estudos recentes sugerem um papel importante de bactérias termofílicas do Phylum Firmicutes, presentes em solos temperados, na fertilidade dos mesmos, por meio da produção de sulfato e amónia, elementos importantes na nutrição das plantas. Neste trabalho pretendeu-se avaliar a dinâmica da população de bactérias termofílicas de um solo temperado agrícola, e a dos seus potenciais antagonistas quanto à utilização de sulfato e amónia pelas plantas, as bactérias sulfato-redutoras e as bactérias oxidativas da amónia da classe β-Proteobacteria, respetivamente. Dois fatores capazes de alterar a diversidade dessas populações são a temperatura e o cobre, este último frequentemente utilizado em tratamentos fitosanitários. A diversidade microbiana relativa a estes grupos, sob influência do cobre e da temperatura, foi avaliada através da técnica de DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis), uma técnica de fingerprint molecular. Como resultado deste estudo, identificaram-se bactérias resistentes ao cobre, presentes no solo agrícola analisado e pertencentes aos grupos taxonómico alvo, e concluiu-se sobre a sua contribuição para a fertilização no solo tratado; ABSTRACT: Recent studies suggest an important role of thermophilic bacteria of the Phylum Firmicutes in soil fertility, through the production of sulphate and ammonia, important elements in plant nutrition. In this work, we evaluated the dynamics of the thermophilic bacteria population in a temperate soil, as well as the one of their potential antagonists on the use of sulphate and ammonia by plants, i.e. sulfate-reducing bacteria and ammonia oxidizing β-proteobacteria. Temperature and copper are factors changing the diversity of these populations; the latter is often used in phytosanitary treatments. The change on the microbial diversity in each of these groups, under the effect of copper and temperature, was evaluated by DGGE (Denaturing Gradient Gel Electrophoresis), a molecular fingerprint technique. As a result of this study, we identified copper resistant bacteria belonging to the targeted taxonomic groups, and we concluded on their contribution for fertilization in the copper treated soil.